4D-lable free蛋白組
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Label-free定量蛋白質組學技術因為其操作簡單、不依賴于昂貴的標記試劑、單次實驗不受樣品數限制等獨特優勢而備受廣泛重視。但傳統的label-free技術由于受質譜儀靈敏度和掃描速度等性能的限制,在不分級的情況下檢測深度往往無法達到科研要求。
4D-label free蛋白質組學是基于timsTOF Pro離子淌度平臺的非標記定量蛋白組學技術,通過數據依賴性采集-同步累積連續碎裂(ddaPASEF)掃描模式進行差異定量蛋白質組學分析。該技術是對傳統label free蛋白質組學的升級,其核心是將數據依賴采集(DDA)與同步累積連續碎裂(PASEF)相結合,外加第四維度的離子淌度分離(基于肽段的碰撞截面積CCS)。由于4D label-free技術的定量信息比傳統label-free多了一維離子淌度信息,使得定量結果更準確,定量可重現性更好;提高了離子利用率和準確度,以更少上樣量、更快掃描速度,實現蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。
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1. 4D技術:采用布魯克的timsTOF Pro質譜平臺,與傳統label-free相比增加一維離子淌度信息,使定量結果更準確、重現性更好;
2. 適用于微量樣本:離子利用率和準確度提高適用于微量樣本,更好解決臨床樣本少的問題;
3. 可用于不同物種間的“有無差異蛋白”比較;
4. 超高定量準確度∶高通量,覆蓋度更深,更穩定,定量更準確,數據更可靠。
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?實驗路線:

數據分析路線:

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植物農林領域:抗逆脅迫機制、生長發育機制、育種保護研究等;
基礎研究:各種物種的蛋白質組草圖構建、蛋白作用機制與特殊功能蛋白質篩選;
臨床診斷:生物疾病標志物研究、生物疾病發生過程分子機制、個性化治療、腫瘤相關研究、臨床微量樣本檢測(如:外泌體、FFPE石蠟切片、活檢穿刺組織等)等;
藥物靶點:化學或生物藥物作用靶點研究、化學或生物藥物作用機理信號轉導研究、藥物應答、基因敲除/過表達的蛋白表達譜分析、疾病生物標志物與藥物作用靶點高通量分析等;
微生物領域:致病機理、耐藥機制、病原體與宿主相互作用研究、脅迫逆境生理研究等。
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具體的預處理及存儲運輸方式,請咨詢技術支持與銷售工程師;所有樣品應避免反復凍融。
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布魯克timsTOF Pro捕集離子淌度質譜。
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